1、病原体耐药性强：很多男性在患尿道炎的初期，由于治疗不规范，盲目用药，破坏体内环境，并造成衣、支原体因耐药，从而导致治疗效果不佳，时好时坏，也较终导致了尿道炎反复发作的现象。

　　2、尿道炎患者免疫力低下：一些患有糖尿病、肿瘤、肝病、营养不良或其他慢性疾病的男性，在患上尿道炎后，由于自身的体抗力底下，导致尿道炎出现反复发作，使得尿道炎的治疗变得很困难。

　　3、隐深部位的感染：一些致病细菌会潜藏于尿道隐窝、尿道旁腺等部位，常规的治疗无法将其消灭干净。同时急性尿道炎有可能伴发前列腺炎，当尿道炎治疗后，仍可因来自前列腺的感染而使尿道炎反复发作，并且由于病菌在治疗过程中易产生抗药性，也给治疗的难度带来很大困难。

　　4、治疗不彻底：部分接受治疗的尿道炎患者在治疗一段时间后感觉病症减轻了，就擅自中断治疗，不遵从医嘱，导致之后尿道炎再次发作。还有一些男性在治疗过程中不注意良好的生活习惯，导致治疗的效果不佳，影响身体恢复。